OTD Chile se constituyó el 19 de enero de 2015 con el objetivo de convertirse en una organización referente del activismo trans y cuestionar la imposición de identidades binarias. Fue fundada por integrantes de la antigua Organización de Transexuales por la Dignidad de la Diversidad y se integró al Frente de la Diversidad Sexual. Desde su inicio la asociación ha liderado campañas por la Ley de Identidad de Género y ha promovido proyectos culturales como la revista Le Trans (2015) y el festival TransFest.